• Kolekcja roślin naczyniowych (SLTC-VP). Liczebność: 55 000 okazów
• Kolekcja grzybów (SLTC–F). Liczebność: 2950 okazów
• Kolekcja porostów (SLTC-L). Liczebność: 11 000 okazów
• Kolekcja mszaków (SLTC-B). Liczebność: 445 okazów.

Większość tych zbiorów pochodzi z Pomorza, ale również z Sudetów, okolic Świdnicy, Świeradowa Zdroju i Wołowa, a także z Macedonii, Capri i Pompei. Ponadto w zbiorach wyróżnia się zielnik Słowińskiego Parku Narodowego w liczbie 900 alegatów. Stanowi on cenny historyczny dokument o florze naczyniowej tej części Pomorza. Integralną częścią zbiorów jest również zielnik dawnego Ogrodu Botanicznego w Sławnie z przełomu XIX i XX wieku w liczbie 78 kart roślin naczyniowych. Kolekcja botaniczna Herbarium posiada w swych zbiorach szereg roślin wymarłych i zagrożonych wyginięciem w skali całego kraju, jak również w skali Pomorza (por. zbiory Karla Friedricha Kohlhoffa i Fritza Römera).
W ramach projektu minimum 70 000 najbardziej unikatowych alegatów pochodzących z zasobów Herbarium Slupensis SLTC zostało zdigitalizowano i udostępniono cyfrowo.