W ogrodzie znajdują się również gatunki chronione, rzadkie i zagrożone, pozyskane z wiodących ogrodów botanicznych, w tym: UAM w Poznaniu, UJ w Krakowie, UMCS w Lublinie oraz Centrum Zachowania Różnorodności Biologicznej PAN w Powsinie.

Uzupełnieniem kwater systematycznych są wybrane kolekcje narodowe, m.in.: Hedera (OB Uniwersytetu Wrocławskiego), Hemerocallis (OB Wojsławice) oraz trawy i turzyce (Ogród Botaniczny IHAR BIP w Bydgoszczy).

Na terenie Ogrodu swoje miejsce znalazły także rośliny użytkowe, lecznicze i przyprawowe, ozdobne ogrodów wiejskich, okrywowe i inwazyjne, co czyni go atrakcyjnym miejscem dydaktycznym i naukowym. Ogród stanowi przestrzeń do obserwacji różnorodności roślinnej oraz nauki o ochronie przyrody i ekologii roślin.